有机肥发酵设备不但从机器根本转变造粒过程，还要进行多层次的节能工艺改造，该设备主要由发酵室、上料加料系统、高压送风系统、主轴传动系统、液压动力系统、自动出料系统、除臭系统和自动控制系统组成。工艺流程包含：混料调制上料、好氧发酵、自动放料三个过程。

　　1、混合料上料部分

　　混合部分是将含水率70%左右的粪便或有机废弃物按规定比例与回流料、生物质、发酵菌混合，调节含水率、密封性等，达到发酵条件。原料含水率在55-65%时，可直接在罐内发酵。

　　2、发酵罐部分

　　该工艺可分为高速加热阶段、高温阶段和冷却阶段。物料进入发酵罐，在好氧菌作用下24-48小时内分解。释放的热量使材料温度升高，一般为50-65℃，有时可达70℃。通过送风曝气系统，向发酵罐均匀供氧，满足发酵过程的需氧量，使物料进行发酵分解，高温阶段维持5-7天。当分解速度缓慢下降时，温度逐渐下降到50℃以下。有机肥发酵设备的整个发酵过程持续7-15天。废气和水蒸气处理后通过除臭系统排出，以减少物料体积，达到物料减量化、稳定化和无害化处理的目的。

　　3、自动送料部分

　　发酵室物料在主轴和重力作用下，经下落发酵后作为有机肥物料排放，含水率不高于30%。

　　随着现代科学工艺的不断进步，对有益菌群进行人工筛选、分离和栽培工艺，将有益植物投入到有机肥料中，有机肥发酵设备可生产出多种生物有机肥料，完善土壤质量，减少环境污染，增加肥料利用率等。